Do hệ thống tiêu hóa bẩn, chứa nhiều chất độc và nấm Candida, sau khi dầu dừa diệt nấm thì dồn xuống chưa kịp thải ra gây nên hiện tượng đau bụng, sốt, lạnh, choáng váng. Đây là hiện tượng bình thường, không đáng lo lắng. Vậy nên cần cố gắng tiếp tục làm cho đến khi cơ thể sạch thì mới khỏe được.
Hiện tượng tiêu chảy là bình thường ra do chất béo bão hòa chuỗi trung bình trong dầu dừa - là chất chính diệt virus, cũng mang tính nhuận tràng (làm lỏng phân), nhưng nhiều khi, có người lại cảm thấy chướng bụng do không đi đại tiện được bởi do các acid béo này tập trung tối đa vào việc diệt khuẩn.